Pod crijevnom florom ili mikrobiotom crijeva se podrazumijevaju svi mikroorganizmi koji se naseljavaju u probavnom traktu. U ljudskim crijevima ima više mikroorganizama (pretežno bakterije) nego što imamo ćelija u tijelu. Crijevna flora predstavlja prvi od 3 zaštitna nivoa u crijevu i usko je povezana s imunološkim intestinalnim (crijevnim) sistemom.
